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校徽由中英文校名、海水纹、椰树、“HN”外文字、创办年份等要素组合而成，整体造型采用国际著名学府普遍使用的象征权威教育机构的盾牌形状，设计风格简洁大方、严谨高雅、清新自然，具有时代感和国际化特色，易于传播。

抽象的海水纹图和椰树浅影体现了海南的热带区位优势，彰显了学校“热带、海洋、特区、旅游”的办学特色，在视觉上也增加了校徽的层次感、节奏感和空间感；校徽中心位置代表“海南”的外文字“HN”稳重有力地抓住了受众的视觉，字母H、N左右重叠交融而成，被渐行渐远的海水托起，既反映了两校合并的历史渊源，又蕴含了“海纳百川、大道致远”的校训精髓。

校徽主色调采用校色“海大蓝”单色设计，代表广阔海洋和蓝天，象征着科技、严谨、理性和智慧；彰显了海大的治学态度和大学精神，与学校的整体文化融为一体。